衛福部健保署每年編列「健保新藥」的預算，去年執行率恐將創下史上新低紀錄。去年8月下旬，台灣癌症基金會等多個罕病團體召開記者會，指出健保新藥預算編了22.68億元，但是直至第2季結束，新藥預算僅用0.86億元，預期去年度新藥預算執行率很難突破10%。
此外，立法院衛環委員會也在12月5日舉行「全民健康保險制度之現況與展望」公聽會，在場八個醫院協會代表抨擊，國內新藥及醫療新科技納入健保給付額度過低，健保支出占GDP比重嚴重落後先進國家標準。
對此，衛福部長薛瑞元回應，健保過去一直定期檢討，此問題或是新的檢討契機，衛福部會持續與各界溝通。至於健保總額要不要更動，涉及修法，只要社會有足夠共識就可以推動；衛福部次長石崇良表示，健保新藥預算，需要一步步解決。
近年政府大力推動生醫產業、本土新藥上市，迄今產官學研投入研究、開發新藥金額已數千億元，生醫產業總市值也達到約1.5兆元。但諷刺的是，政府鼓勵台灣產業界開發新藥，迄今多項產品開花結果，但健保署每年編列的預算僅二、三十億元，今年上半年執行的金額更不到1億元，真正給付本土新藥的部分更少。業界質疑，多年來這些沒執行完的預算結餘款都去哪了？
事實上，自從健保給付新藥預算編列以來，其執行率一直很難突破10%，罕病團體召開記者會的四個月後，台灣癌症基金會副執行長蔡麗娟近日回應本報指出，「健保署至今未做任何改善與回應，罕病團體仍不知原因為何」。
陽明交大藥物科學院院長、台灣首任食品藥物管理局（TFDA）康照洲推測：「應該是共同擬定會議專家們不認同罕病團體的計價方式，但是他們又不願意公開自己版本的計價方式」。
前健保局總經理張鴻仁則認為，健保新藥預算編列了多少金額，就應該好好執行，但他認為這還不是最大問題，張鴻仁點出更嚴重的困境，台灣健保總額給新藥預算過低，「歸根究底是大水庫的水量太少」。全世界已開發國家醫療支出年年成長，經濟暨合作開發組織（OECD）國家平均12.6%，亞洲鄰國日本為11%，南韓也有7.6%，但台灣醫療支出占GDP比重僅6.6%，多年來一直未成長。
張鴻仁強調，人口老化愈來愈嚴重，加上醫療科技發達，富裕國家醫療支出高於GDP的成長，「這是全世界理所當然的趨勢，唯有台灣過去20年來健保總預算不僅未增加，而且距全民醫療需求的空缺愈來愈大」。
陽明交通大學教授周穎政直言，台灣自詡醫療服務、健康照護體系世界第一，但是因為醫療保健占GDP比重僅有6.6%，包括新生兒死亡率、過去20年國人平均餘命、急性心肌梗塞住院後30天及一年死亡率，或乳癌、肺癌、攝護腺癌存活率等指標，均落後日本、南韓及新加坡等亞洲國家。
台灣醫務管理學會理事長洪子仁指出，台灣醫療體系未來應加速走向智能化、數位化的智慧醫療，若政府繼續從成本角度制定健保預算，未來再也沒有任何一家生技藥廠及科技公司願意投資醫療創新。
衛福部每年編列健保新藥預算不足，不僅罕病團體受苦，開發新藥產品的本土生技公司也同樣叫苦連天，其中，全球積極發展的智慧醫療產品也因為健保不給付，造成醫院買單意願低落。
對此，行政院生技產業策略諮議委員會議（BTC）今年9月提出建議，政府應在健保總額預算之外推出「健保沙盒」，提供本土新創（藥品、醫材）產品以兩、三年時間驗證品質及醫療經濟效益，若通過驗證，再提供正式的健保給付。
BTC委員代表、上騰生技顧問公司董事長張鴻仁表示，台灣發展生醫產業最大瓶頸就是市場准入，創新產品進不到醫院，其中關鍵重點是健保預算不足。他強調，不管是新藥還是創新醫療科技，政府應將其納入健保給付，但是有鑑於健保總額擴張有一定腳步，因此可以先以沙盒來試驗。
張鴻仁解釋，所謂的「健保沙盒」是指在健保總額預算之外，由行政院另外編列預算，針對已獲衛福部食藥署通過的創新產品（尤其是智慧醫療與精準醫療），在健保平台試用一定時間，同時進行成本效益分析，證明有用後，再納入健保給付。
至於「健保沙盒」的預算應該編列多少預算才充足？張鴻仁提議，至少應撥出健保總額預算逾8,000億元的百分之一，也就是80億元，「這才能顯示政府推動改革的誠意吧！」
除了張鴻仁，國內另一位健保財務專家、逢甲大學財稅系特約講座謝啟瑞提出，政府應視醫療支出為一種對民眾健康的投資，考慮新增一般稅收財源挹注健保。
謝啟瑞表示，政府可鼓勵台灣醫療體系有創新動能，只是目前因為健保點值下降，造成醫院收入減少，也壓縮了醫院從事各種創新的內部基金。要是醫療院所沒有足夠的盈餘，未來民眾就享受不到新的療程、新的設備及新治療方式。
因此謝啟瑞主張，政府應在現有的健保總額預算之外，新增一般稅收財源，獎勵醫療院所創新，讓醫院從事創新的固定資本投資，能得到合理的報酬。
謝啟瑞解釋，這是一種「二加二健保改革方案」，針對現有的醫療產品及醫療行為，繼續由健保總額預算去支付；新的財源收入則用來補助創新成果，前提是這些創新成果必須按結果來付費，如此才能鼓勵生技公司或科技業者開發的新產品被醫院採用。
